O BioMar locado no Departamento de Engenharia de Pesca, possui uma área de aproximadamente 300 m2 conta com balança semianalítica; centrífugas para microtubos e de escala industrial (Beckman); destilador; liofilizador industrial (Liotop), agitadores magnéticos, moedores, potenciômetro, bloco térmico e uma variedade de matrizes cromatográficas para a purificação de proteínas. Além disso, possui equipamentos modernos para análises estruturais, incluindo um Dicroísmo Circular Jasco modelo J-815; um sistema de cromatografia de ultra performance (WATERS) contendo colunas cromatográficas diversas, coletores de fração e bombas peristálticas.
O BioMar conta também com uma unidade equipada de cultivo de microrganismos e células. Esta unidade possui estufas, autoclave, fluxo laminar, freezer para o armazenamento de cepas bacterianas, espectrofotômetro e mesa agitadora, além de uma enorme variedade de cepas bacterianas patogênicas e não patogênicas.